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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

读懂新年贺词中的“奋斗密码”******

　　旧岁已展千重锦，新年再进百尺杆。习近平主席在2023年新年前夕，发表了温暖明亮、直抵人心的新年贺词。透过新年贺词，我们可以从“年终盘点”中找寻奋斗的身影，从“频频金句”中感受时代的温度，更能从“惦念嘱托”中获取奋斗的“密码”。胜利属于奋斗者，星光不负赶路人，广大党员干部群众当从新年贺词出发，瞄准未来中国的美丽图景，用奋斗的姿态走好新的赶考之路。

　　勇担奋斗之责。2022年是极不平凡的一年，我们看到了“上天、入地、下海”的科技之美，看到了冰雪健儿奥运盛会上的竞技之美，看到了祖国广袤土地上硕果累累的丰收之美……这些“美丽画卷”的形成源于以习近平同志为核心的党中央的正确领导，源于广大党员干部群众追求美好生活的奋斗之力。党的二十大擘画了全面建设社会主义现代化国家、以中国式现代化全面推进中华民族伟大复兴的宏伟蓝图，吹响了奋进新征程的时代号角。光景越是美好、征途越是光明，越需要我们持续奋斗、勇毅前行，越需要我们争做“主人翁”，始终做到把自己摆进事业中，把责任扛在肩膀上，不断强化“强国有我”的奋斗担当，奋力把党的二十大绘就的蓝图变成现实，继续把中华民族伟大复兴的历史伟业推向前进。

　　砥砺奋斗之志。2022年是极具挑战的一年，但广大党员干部群众奋斗的志气没有消磨，攻坚的毅力没有减退，一幅幅平凡英雄的斗争光影令人难忘，“疫情要防住、经济要稳住、发展要安全”的要求在克难攻坚中得到落实，中国经济顶住压力、稳中求进。事实证明，志之所趋，无远弗届；志之所向，无坚不入。迈向新征程，风险与机遇同在、挑战与发展共存，我们须牢记习近平总书记“路虽远，行则将至；事虽难，做则必成”的殷殷嘱托，在伟大民族精神中汲取源源不断的斗争养分，不断涵养志气和毅力，以最饱满最昂扬的斗争姿态，把宏伟目标变为美好现实。

　　凝聚奋斗之力。独行者快，众行者远，正如习近平主席在新年贺词中提到的“14亿多中国人心往一处想、劲往一处使，同舟共济、众志成城，就没有干不成的事、迈不过的坎”。力量源于团结，团结来自人心，团结就是胜利。在过去一年里，我们忘不了“天使白”“守护蓝”“志愿红”以团结之力抗击疫情，忘不了党政军民团结一心抢险救灾，也忘不了冬奥会上冰雪健儿传递出“更团结”的心愿……在以中国式现代化全面推进中华民族伟大复兴的新征程上，每个人都不是“孤勇者”，都是参与者、书写者、奋斗者，只有心往一处想、劲往一处使，才能凝聚起战胜前进道路上各种风险挑战、打开事业发展新天地的磅礴力量。

　　走过泥泞，方知大道珍贵；历经风雨，更觉阳光美好。2023年如约而至，在新年贺词这首温暖的“新年序曲”之下，让我们勇担奋斗之责、砥砺奋斗之志、凝聚奋斗之力，去迎接明天更有力量、更有希望的中国！（张磊）

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）